Les lois de décentralisation ont eu pour conséquence de conférer aux EPLE une certaine autonomie, notamment en matière pédagogique et éducative.
Cette autonomie trouve sa traduction concrète dans le projet d'établissement qui énonce des objectifs et des programmes d'action et dans le règlement intérieur qui définit les droits et les devoirs de chacun.
L'autonomie de l'établissement fait toute sa place à la liberté d'association et à la liberté d'expression.
Les élèves et leurs parents sont membres de la communauté éducative, ils sont acteurs à part entière et la FCPE entend que leur rôle soit pleinement reconnu.
Le conseil d'administration est présidé par le chef d'établissement qui de fait préside l'organe dont il a à exécuter les décisions. La FCPE est favorable au principe de séparation des pouvoirs entre la direction de l'établissement et la présidence du conseil d'administration.
La situation actuelle a parfois pour conséquence que l'expression des représentants des élèves et des parents ne soit pas entendue à égalité de celle des autres membres.
La même appréciation prévaut en ce qui concerne la commission permanente dont il convient ici de rappeler qu'elle doit, en certaines matières, être obligatoirement saisie avant le conseil d'administration.