Il est crée dés 1945 et dépendra au départ du ministère de La Santé, puis de celui de l'Education Nationale au gré des missions qui lui seront confiées : problèmes de santé publique ou acteurs de la réussite scolaire.
En janvier 2001, il devient " mission de promotion de la santé en faveur des élèves " accomplie par deux corps professionnels individualisés : médecins (circulaire n° 2001-013 du 12/01/01) et infirmier(ère)s (circulaire n° 2001-014 du 12/01/01) aidés dans leur tâche par des secrétaires médicales.Tous font partie intégrante de l’équipe éducative
http://www.education.gouv.fr/bo/2001/special1/texte.htm(Code de l’Education art. L 913-1).
Parallèlement existe un service social de l'Education Nationale.
La mission de promotion de la santé en faveur des élèves est précisée dans le Code de l'Education : Livre I, Titres I et II. Elle prévoit le dépistage et suivi de santé des élèves dès lors que des problèmes ou des carences peuvent engendrer des difficultés d’apprentissage ou les mettre en situation d’échec scolaire.
Les orientations générales pour la politique de santé en faveur des élèves sont spécifiées dans la circulaire 2000-012 du 12 janvier 2001 ( BOEN n°1 SP du 25 janvier 2001) qui définit les missions des médecins et des infirmières scolaire en particulier dans le dépistage et les repérage des signes pouvant entraîner des difficultés ultérieures d’apprentissage, dans l’intégration des jeunes handicapés, dans l’accompagnement des élèves et le développement d’une dynamique d’éducation à la santé.
Ces orientations sont reprises dans la circulaire n°2002-098 d’avril 2002 (BOEN 18 du 2 mai 2002) qui souligne en outre l’étroite relation qui doit exister entre les familles et la communauté éducative en matière de santé des élèves.